切换到宽版
|帮助
社区应用
帖子
相册
日志
群组
热榜
分享
记录
最新帖子
精华区
社区服务
朋友圈
会员列表
统计排行
基本信息
到访IP统计
管理团队
管理统计
在线会员
会员排行
版块排行
帖子排行
用户名
密 码
记住登录
登录
找回密码
注册
快捷通道
关闭
您还没有登录,快捷通道只有在登录后才能使用。
立即登录
还没有帐号? 赶紧
注册一个
门户
试管婴儿论坛
个人中心
群组
广场
试管婴儿日记
咨询园地
交流园地
知识园地
代孕网站园地
妈妈宝宝园地
休闲娱乐区
帖子
日志
用户
版块
群组
帖子
搜索
蓝色天空
水墨江南
黑色旋风
绿之印象
紫色梦幻
麒麟试管婴儿论坛
>
资料文献区
>
工具:miRNA数据库大全
发帖
回复
返回列表
新帖
1694
阅读
0
回复
工具:miRNA数据库大全
[复制链接]
上一主题
下一主题
小丫
UID:11
注册时间
2004-12-20
最后登录
2021-01-19
发帖
3033
搜Ta的帖子
精华
1
金钱
6572
威望
6002
贡献值
12
交易币
0
访问TA的空间
加好友
用道具
总版主
关闭
个人中心可以申请新版勋章哦
立即申请
知道了
发帖
3033
金钱
6572
威望
6002
贡献值
12
交易币
0
加关注
发消息
只看楼主
倒序阅读
0
发表于: 2014-08-15
1、starBase
一个高通量实验数据CLIP-Seq(或称为HITS-CLIP,PAR-CLIP,iCLIP)和mRNA降解组测序数据支持的microRNA靶标数据库,包含了miRNA-mRNA,miRNA-lncRNA,miRNA-circRNA,miRNA-ceRNA 和RNA-protein等的调控关系。整合和构建多个流行的靶标预测软件的交集和调控关系。最新版本发布时间:2013年11月。
网址:
http://starbase.sysu.edu.cn/
2、miRbase
众所周知的microRNA基因注释数据库。目前miRBase只提供了microRNA的靶标的预测软件的链接(如:PicTar)。最新版本发布时间:2010年9月。网址:
http://mirbase.org/index.shtml
3、ChIPBase
整合CLIP-Seq和ChIP-Seq的数据探讨microRNA的转录和转录后调控,构建转录因子->microRNA->靶标的调控网络。最新版本发布时间:2012年11月。
网址:
http://deepbase.sysu.edu.cn/chipbase/
4、Tarbase
一个收集已被实验验证的microRNA靶标数据库。最新版本发布时间:2009年1月。
网址:
http://microrna.gr/tarbase/
5、miRecords
一个整合的microRNA靶标数据库。整合多个靶标预测软件的调控关系。最新版本发布时间:2010年11月。
网址:
http://mirecords.biolead.org/
6、targetScan
基于靶mRNA序列的进化保守等特征搜寻动物的microRNA靶基因。是预测microRNA靶标假阳性率较低的软件。而且是microRNA领域大牛Bartel实验室开发的。最新版本发布时间:2009年4月。
网址:
http://www.targetscan.org/
7、PicTar
基于microRNA或microRNA靶标联合作用等特征开发的搜寻动物的microRNA靶基因。假阳性率也较低。是microRNA领域大牛Rajewsky实验室开发的。最新版本发布时间:2007年3月。
网址:
http://pictar.mdc-berlin.de/
8、PITA
基于靶位点的可接性和自由能预测microRNA的靶标。是著名的生物信息学家Segal实验室开发的。最新版本发布时间:2008年8月。
网址:
http://genie.weizmann.ac.il/pubs/mir07/mir07_data.html/
9、RNA22
基于序列特征预测microRNA的结合位点。是几个流行的microRNA靶标预测软件的其中一个。IBM公司的研究团队开发的。最新版本发布时间:2007年。
网址:
http://cbcsrv.watson.ibm.com/rna22.html/
10、miRanda和microRNA.org
是著名的MemorialSloan-Kettering 癌症研究中心的研究人员开发的软件和数据库。miRanda的最新版本又叫mirSVR。最新版本发布时间:2010年8月。
网址:
http://www.microrna.org/microrna/home.do/
11、MicroCosm
EMBL-EBI的Enright 实验室开发的microRNA靶标数据库。最新版本发布时间:2010年8月。
网址:
http://www.ebi.ac.uk/enright-srv/microcosm/htdocs/targets/v5/
12、miRTarBase
整合实验证实的microRNA靶标的数据库。最新版本发布时间:2010年10月。
网址:
http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/index.html/
13、miRGator v2.0
整合microRNA表达、靶标和疾病相关信息的数据库。最新版本发布时间:2010年11月。
网址:
http://mirgator.kobic.re.kr:8080/MEXWebApp/
14、MiRNAMap
动物的microRNA基因及其靶标的数据库。最新版本发布时间:2008年1月。
网址:
http://mirnamap.mbc.nctu.edu.tw/
15、miRDB
动物microRNA靶标预测和功能注释数据库。最新版本发布时间:2010年8月。
网址:
http://mirdb.org/miRDB/
16、RNAhybrid
一个基于miRNA-target配对自由能预测microRNA的靶标。最新版本发布时间:2011年6月。
网址:
http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/
17、miRGen
microRNA基因和microRNA靶标数据库。最新版本发布时间:2007年1月。
网址:
http://www.diana.pcbi.upenn.edu/miRGen.html/
共
条评分
答复及建议仅供参考!
[点击了解更详细的试管婴儿知识]
回复
举报
收藏到:
QQ空间
新浪微博
腾讯微博
人人网
发帖
回复
返回列表
http://www.ivfbbs.com
访问内容超出本站范围,不能确定是否安全
继续访问
取消访问
隐藏
快速跳转
不孕不育试管婴儿患者咨询交流园地
试管婴儿
女性不孕
男性不育
人工授精
遗传咨询、复发流产、胚胎停育
不孕不育试管婴儿患者分类交流园地
进程记录及心情日记
试管婴儿费用
不孕不育试管婴儿知识园地
不孕不育知识
试管婴儿知识
试管婴儿新闻
试管婴儿医生交流区
资料文献区
相关网站广告园地
代孕新闻
广告位
海外试管专栏
保健、休闲园地
情感交流
健康保健
时尚男女
灌水乐园
意见建议区
意见建议
关闭
关闭
选中
1
篇
全选